Plus de 90 % du génome du rat est séquencé. Il s'agit du troisième mammifère après l'humain (en 2000) et la souris (en 2002) à voir son génome décrypté.
Les chercheurs ont déchiffré 90 % des 2,75 milliards de bases azotées du code génétique du rat brun de Norvège,
Rattus norvegicus. Ce rat de laboratoire le plus commun cohabite avec l'homme depuis des millénaires et a permis de nombreuses découvertes médicales tout comme il a causé de grandes épidémies.
Son génome est plus petit que celui de l'être humain, mais un peu plus grand que celui de la souris. Les trois espèces possèdent par contre environ le même nombre de gènes soit entre 25 000 et 30 000. De ces gènes, 90 % sont communs aux trois espèces. Certains des autres gènes sont par exemple impliqués dans la désintoxication des toxines chez le rat alors qu'ils sont absents chez les deux autres espèces. Le rat pourrait donc être résistant à certaines toxines remettant en cause son utilisation pour tester la toxicité des médicaments.
Le séquençage du génome de plusieurs autres espèces est en cours. Chez les mammifères, ceux du chien, du chimpanzé, du macaque, de l'opossum et de la vache sont en cours de décryptage.