Swift Biosciences lance, à l'appui des initiatives de médecine de précision, des panneaux de cancer Accel-Amplicon Plus

Le nouveau flux de travail de séquençage ciblé combine un contenu prévalidé avec personnalisation facile et de nouveaux outils d'analyse pour accélérer la découverte et la sélection des variantes.

ANN ARBOR, Michigan, 18 avril 2018 /CNW/ -- Swift Biosciences a annoncé aujourd'hui le lancement commercial de ses panneaux de SNG Accel-Amplicon Plustm pour le cancer, une série de neuf panneaux de gènes ciblés et spécifiques aux tumeurs pour faciliter le séquençage ciblé du cancer. La technologie Accel-Amplicon permet la détection simultanée de variantes mononucléotidiques, de variantes du nombre de copies et de petites insertions et délétions pour en arriver à une couverture complète, et au niveau des exon des points chauds, des gènes cliniquement pertinents. Cette technologie permet également aux chercheurs de combiner un contenu prévalidé et leurs propres cibles dans un essai rapide à tube unique, développant ainsi des flux de travail plus instructifs et plus extensibles pour mieux atteindre leurs objectifs scientifiques.   

Chaque tumeur porte en elle une combinaison unique d'altérations génomiques qui peuvent déterminer le taux de croissance de la tumeur et la réponse au traitement. Le séquençage ciblé au moyen de panneaux multigènes ciblés constitue une méthode précise et instructive qui permet d'identifier rapidement des variantes cliniquement exploitables dans des gènes cancéreux connus ou présumés. Cependant, le développement de panneaux de gènes du cancer exige une expertise en bioinformatique pour identifier les marqueurs génétiques ainsi que des ressources supplémentaires pour concevoir, optimiser et valider un test.

Accel-Amplicon Plus offre une capacité modulaire, mélange et appariement, qui donne aux laboratoires de recherche translationnelle une plus grande flexibilité pour déployer plus d'une stratégie. Ces laboratoires peuvent soit commencer par un large ensemble de gènes pour établir un profil complet des tumeurs, puis affiner le contenu jusqu'aux marqueurs les plus informatifs, soit commencer par un test très ciblé pour cribler systématiquement les variantes connues et cliniquement exploitables. Chaque test peut être conçu pour contenir jusqu'à 1 500 amplicons par panneau, lesquels sont conçus et validés en laboratoire par les experts de Swift et entièrement compatibles avec les échantillons dégradés de FFPE ou de biopsie liquide diluée. 

« Les panneaux de cancer Accel-Amplicon Plus pourraient révolutionner la recherche sur le cancer et l'oncologie », a déclaré Haley Fiske, directeur commercial chez Swift Biosciences, expliquant que « les chercheurs cliniques, en intégrant du contenu prévalidé et personnalisable dans un seul panneau, peuvent maximiser les données générées à partir de chaque échantillon tumoral et accélérer leurs efforts pour découvrir et cribler les variantes du cancer. »

Les panneaux de cancer Accel-Amplicon Plus se composent de neuf essais : 

Panneaux de maladies

• Panneau de cancer colorectal Accel-Amplicon Plustm
• Panneau de syndrome de Lynch Accel-Amplicon Plustm
• Panneau de cancer du poumon Accel-Amplicon Plustm
• Panneau myéloïde Accel-Amplicon Plustm

Panneaux de gènes

• Panneau de profilage pantumoraux Accel-Amplicon Plustm 57G
• Panneau de gènes TP53 complet Accel-Amplicon Plustm
• Panneau de gènes Accel-Amplicon Plustm BRCA1 et BRCA2
• Panneau de gènes Accel-Amplicon Plustm BRCA 1, BRCA 2 et PALB 2
• Panneau de cheminement Accel-Amplicon Plustm EGFR

Les caractéristiques et avantages clés des panneaux de SGN Accel-Amplicon Plus pour le cancer sont les suivants :

• Couverture des milliers de mutations cliniquement pertinentes trouvées dans les bases de données COSMIC et ClinVar, y compris celles des régions de points chauds et au niveau de l'exon ou du gène entier des gènes clés
• Détection des variantes rares > 1 % de fréquence allélique pour identifier les mutations germinales ou somatiques dans le même test
• Performances robustes avec aussi peu que 10 nanogrammes d'échantillons provenant d'échantillons FFPE dégradés ou de spécimens limités tels que de l'ADN sans cellules, des aspirats à aiguilles fines ou d'autres petites biopsies
• Compatibles avec tous les séquenceurs Illumina

Avec un contenu hautement informatif, un protocole simple et des résultats fiables, les panneaux permettent plusieurs applications critiques en oncologie, notamment celles-ci :   

• Découverte ou confirmation de variantes somatiques à basse fréquence
• Profilage de tumeurs dans des échantillons frais ou conservés
• Dépistage de la susceptibilité à la maladie, dépistage précoce et récidive
• Efficacité thérapeutique et surveillance

Parallèlement aux panneaux Accel-Amplicon Plus pour le cancer, la société a également Swift Bioinformatics Resources (ressources bioinformatiques Swift), une offre de solutions source ouverte et commerciales pour accélérer l'analyse de grands ensembles de données de séquençage de nouvelle génération (SNG). Les deux premiers outils prennent en charge le flux de travail de reséquençage ciblé de Swift, y compris Primercliptm, un outil à source ouverte servant au découpage d'amorces, et FAST Analysistm, un logiciel de détection intuitif de variantes, développé par Genialis, qui intègre de manière transparente l'alignement, l'appel d'allèles et le rapport de synthèse.

Les panneaux de SNG Accel-Amplicon Plus pour le cancer sont maintenant disponibles dans le commerce. Pour en savoir plus, rendez-vous sur www.swiftbiosci.com.

À propos de Swift Biosciences

Swift Biosciences, établie à Ann Arbor, au Michigan, est la société de référence dans la préparation de banques SNG. Swift Biosciences développe des solutions novatrices destinées à la préparation de banques pour des applications émergentes basées sur le séquençage de nouvelle génération, notamment le séquençage du génome entier, le séquençage d'ADN ciblé et l'analyse épigénétique.

Les produits de Swift Biosciences sont conçus pour aider les clients à analyser les échantillons biologiques difficiles, et ce, plus rapidement, plus facilement, avec une sensibilité et une précision accrues, tout en étant compatibles avec les instruments de pointe. Swift Biosciences est la première société à proposer des solutions de préparation de banques sur les trois principales plateformes de séquençage, c'est-à-dire Pacific Biosciences^®, Illumina^® et Ion Torrenttm.

La société a ouvert ses portes en février 2010 et le développement de ses produits permet de nouvelles applications dans de nombreux secteurs parmi lesquels l'agrogénomique, le domaine pharmaceutique, le monde universitaire, la biotechnologie et la recherche en oncologie.

Pour en savoir plus, consultez le site SwiftBioSci.com et suivez Swift Biosciences sur Twitter à l'adresse @SwiftBioSci.

SOURCE Swift Biosciences