Swift présente la méthode de préparation de banques de séquençage de méthylation unicellulaire offrant le plus grand débit de traitement

L'étude publiée dans Science Magazine démontre comment les marqueurs épigénétiques peuvent identifier les sous-types cellulaires et les éléments régulateurs qui déterminent la diversité cellulaire

ANN ARBOR, Michigan, 11 août 2017 /CNW/ - Swift Biosciences, l'un des principaux fournisseurs de solutions innovantes permettant la préparation de banques pour le séquençage de prochaine génération (NGS), annonce aujourd'hui le lancement d'une méthode novatrice de séquençage de méthylation unicellulaire fondée sur sa technologie Accel-NGS® Adaptasetm, une solution robuste et efficace de préparation de NGS pour le séquençage bisulfite du génome entier à une résolution unicellulaire. Cette nouvelle méthode permet d'analyser efficacement les différentes régions méthylées parmi des milliers de cellules issues de tissus hétérogènes tout en permettant diverses applications, comme la classification cellulaire, la régulation des mécanismes cellulaires dans des tissus normaux, les altérations épigénétiques en état pathologique, et la conservation évolutive de la régulation épigénomique.

La méthylation est un biomarqueur stable qui peut servir à identifier les types de cellules et les éléments régulateurs sous-jacents de la fonction cellulaire. Lorsque conjuguée aux études d'expression de l'ARN unicellulaire, la méthylation unicellulaire peut élucider les éléments régulateurs, contrôlant du même coup les profils d'expression uniques des cellules individuelles et des différences intercellulaires. De plus, des études cliniques récentes ont découvert les schémas de méthylation de certaines maladies, dont le cancer, qui identifient le type de tumeur et la charge tumorale dans les biopsies liquides, et corrélent la progression de la maladie avec le pronostic et la réaction aux médicaments.

Cette méthode a été décrite récemment dans un article publié dans Science, intitulé « Single Cell Methylomes Identify Neuronal Subtypes and Regulatory Elements in Mammalian Cortex », par les collaborateurs de Salk Institute, de l'University of California San Diego et de Swift Biosciences. Le processus conjugue l'isolation par tri des cellules activées par fluorescence, la conversion bisulfite et le module Accel-NGS Adaptase de Swift avec d'autres composants offerts commercialement. Les résultats publiés démontrent une augmentation plus de deux fois supérieure des taux de lecture-cartographie en comparaison aux autres méthodes, augmentant de manière importante la sortie de données par lot de séquençage tout en réduisant le coût global.

« C'est l'une des nombreuses collaborations scientifiques permettant à Swift Technologies de repousser les frontières de la science », soutient Timothy Harkins, président et chef de la direction de Swift Biosciences, et coauteur de l'article. « Nous nous réjouissons des nouvelles constatations relativement aux processus cellulaires de base et du profond impact futur qu'elles auront sur la médecine de précision. »

« Notre technologie exclusive Adaptase crée des banques NGS hautement complexes à partir d'une faible quantité d'ADN monocaténaire », souligne Laurie Kurihara, Ph. D., directrice principale de la recherche et du développement, et coauteure de l'article. « Notre processus unicellulaire compte moins d'étapes que les autres méthodes et offre la transformation unicellulaire multiplexée pour accroître la productivité des applications à débit élevé. »

Le module Accel-NGS Adaptase est désormais en vente.

SOURCE Swift Biosciences